Par ailleurs si tu veux que ce soit le plus possible compatible avec ton installation debian, tu peux installer le package kernel-package, qui sert, à partir des sources du noyau menuconfiguées à ta sauce, à créer un package debian (enfin deux, un pour l'image et un pour les modules) au lieu de l'installer directement.

En gros ça s'utilise de la façon suivante : tu vas dans les sources, tu fais make menuconfig, mais au lieu de faire make bzImage etc. tu fais "make-kpkg kernel_image" et ça te génère un .deb que tu peux installer avec dpkg. (Et normalement ça ne désinstalle pas ton ancien noyau et tes anciens modules, parce que le package a un nom différent — enfin à vérifier mais il me semble que ça me générait un package avec un nom distinct du package officiel ; tu dois avoir l'option dans grub pour booter l'un ou l'autre après installation.)