Ben nativement (au niveau du FS) tout se fait encore en Posix. Quand on utilise les commandes de base, on tape dans ces droits là.
La gestion des ACL se fait de façon supérieure, avec d'autres commandes, d'autres outils, et n'est pas enregistrée de la même façon (je ne sais pas comment c'est géré actuellement - a priori, ça a l'air de l'être en natif par ext3, mais avant c'étaient de simples métadonnées dans des fichiers invisibles).

Ce qui est dommage, c'est que la révision e de Posix n'ait pas été finalisée et adoptée... en l'état actuel des choses, rien n'est normalisé, tout le monde implémente le brouillon inachevé.