http://fr.wikipedia.org/wiki/Plaque_de_Pioneer#Position_relative_du_Soleil_au_centre_de_la_galaxie_et_14_pulsarsEn galactique il est possible de calculer sa position par rapport aux pulsars.
Mais j'imagine que les sondes spatiales (du moins les anciennes) ne sont pas équipées de ce genre de système, et que leur position est calculée par rapport à leur trajectoire, leur vitesse et le délai de transmission d'information pour confirmer. Leur but premier était d'explorer les planètes, pas l'outer space.