ClamAV est ce que j'utiliserais en tout cas. La détection n'est plus si pourrie que ça (les critiques sur ça datent quand-même d'une décennie environ!) et le logiciel est maintenant développé par Cisco.

Mais il y a aussi des antivirus propriétaires qui ont une version GNU/Linux: https://en.wikipedia.org/wiki/Comparison_of_antivirus_software#Linux – il y en avait quelques autres, mais malheureusement, ils ont été abandonnés (surtout ceux gratuits).