Ah oui pas bête, dans ce cas ça devrait marcher...
Après un coup d'œil à mes slides de popl, j'ai eu le même problème que toi mais il a pas l'air résolu (or j'ai bien mis un \vfill dans la source, je sais pas trop comment beamer bidouille son truc pour l'ignorer, il doit y avoir des manipulations louches de \box, mais bref la solution logique ne marche pas) (la différence c'est que dans mon cas c'est l'image qui change)