FAT32 c'est 4 Go (moins 1 octet) comme taille de fichier maxi. La limite à 2 Go, c'est uniquement certains progs qui stockent la taille sur un entier 32 bits signé ; c'était le cas par exemple du code de gestion des vidéos AVI, avant.
Sinon, on avait déjà discuté d'un sujet similaire y'a pas longtemps :
topics/127392-sauvegardes-ntfs-ou-fat32