pour ma part, ceci marche sans pb :

<?php
ob_start();
$content = ob_get_clean();
$fileContent = "<page><h1>Exemple d'utilisation</h1></page>";

require_once(dirname(__FILE__).'/html2pdf.class.php');
$html2pdf = new HTML2PDF('P','A4','fr');
//$html2pdf->setModeDebug();
$html2pdf->setDefaultFont('Arial');
$html2pdf->WriteHTML($fileContent);
$html2pdf->Output('mon_doc.pdf','D');
?>

vous exécutez votre script tout seul, ou dans un moteur de site ou un framework quelconque ? quelle version de HTML2PDF utilisez vous ?