Bof, c'est très bien géré quand tu montes un dossier avec cifs (depuis un serveur Windows, même pas depuis du Samba) : il y a des notions de propriétaire dans le monde MS qui pourraient très bien servir à la fois pour le user et le groupe unix.
Sinon, la possibilité de faire comme avec Samba : un paramétrage à faire pour déterminer que faire par défaut lorsqu'il y a une ambiguïté.

Après, ça ressemble quand-même à une limitation du driver NTFS côté Windows (par choix ?) qui ne renseigne pas ces informations alors qu'il pourrait (en utilisant les informations d'utilisateur Unix au moment de la création du fichier, par exemple).