L'usage abusif est très facile à détecter (ça fait du bruit), un hdparm suffit pour le corriger, et si on ne laisse pas traîner le problème pendant une éternité, l'usure est minime. Bref, pas un vrai problème.
Sinon, une solution est de garder le disque dur occupé (par exemple en jouant de la musique depuis le disque dur, ou en faisant un while true; do sleep 3; touch ~/foo; sync; done), comme ça il ne va pas se mettre en mode repos.
