Il faudrait prendre le maglev qui a un fonctionnment quasi similaire.

Regarde le comportement et le placement des aimants, ils sont alignés, attirant et repoussant le projectile chargé magnétiquement, la force du champs magnétique est "perpendiculaire" au projectile, la force en réaction l'est donc aussi.
Il y a bien des forces supplémentaires dans le sens du déplacement du projectile, evidemment, mais elles sont bien moindre que pour un profectile conventionnel qui n'est que propulsé par un seul vecteur et donc n'aura une force de réaction majeure que dans le sens contraire.
Pour le railgun la grande partie des vecteurs sont générés par les solénoides tout le long du fut (du rail, d'où le nom).