Si tu as un STE, tu peux les formater dessus depuis le bureau, elle seront reconnues par Windows.
Si tu a un STF, le formatage est légèrement différent du standard DOS (mais compatibles tous atari ST-> Falcon), il faut donc passer par un utilitaire de formatage qui te génèrera des disquettes 100% MS-DOS, lisibles sur PC.

Bon, sous réserve que XP gère les 720ko en lecture/écriture, on ne sait jamais...