)
en général il n'y a aucun fichier à exclure du référencement, dans la mesure où les fichiers top-secret ne devraient de toute façon pas être accessibles au public si ton site est bien configuré
(mais vérifie qd même en tapant l'adresse des fichiers top-secret dans ton navigateur)
par contre ça peut être utile si t'as deux url avec grosso modo le même contenu (genre si tu as une version imprimable, c'est un peu bête de la référencer alors qu'il y a déjà la version normale qui convient mieux)
pour le référencement si tu as personne qui linke vers ton site tu seras de toute façon pas très bien référencé même avec un référencement manuel, et inversement si tu as des liens vers ton site je pense pas que ça change gd-chose de faire le référencement ^^ (enfin ça coûte rien non plus de le faire pour les 2-3 moteurs les plus connus)