Du courage. Si tu t'y connais deja en Basic autant passer au C, car c'est completement different.
Pense a utiliser le Modele Objet en ayant recours aux structures au lieu d'avoir un millier de variables.
Dans l'absolue, tu devrais avoir une seule structure qui contient toutes tes donnees(laquelle structure contient des structures et ainsi de suite).

L'avantage de proceder ainsi, c'est que tu n'auras que comme variable dans le programme une pointeur sur la structure de donnees principale, que tu (des)alloueras ensuite dynamiquement a l'interieur du programme.
Pour acceder aux structures a l'interieur de ta structure de donnees principale, tu fais des MACROS avec ou sans parametres.
Comme cela si a l'avenir tu modifies le format de ta structure de donnees principale, tu n'as qu'a modifier les MACROS pour que la prise en compte soit automatique.