Et le meilleur cryptage de dossiers reste toujours rm -rf. Si les données sont tellement dangereuses qu'il faut les crypter, il vaut mieux ne pas les avoir sur le disque du tout.

Pour les usages courants, genre ton dossier home crypté pour se protéger des vols de PCs portables, les solutions comme LUKS fonctionnent parfaitement (il est de toute façon conseillé d'avoir une partition home, sur un PC personnel ou familial, ça ne va pas demander beaucoup plus d'efforts d'avoir une partition home par utilisateur).