En théorie, les OS modernes permettent l'échange d'UTF-8.

En pratique, comme:
* les programmeurs ne font pas attention à Unicode, que ce soit dans nombre d'applications, ou même les filesystems eux-mêmes (les FAT, manifestement, d'après des transferts que j'ai faits);
* les utilisateurs font parfois des bêtises (j'ai déjà fait des transferts avec NTFS depuis *nix, et j'ai eu des problèmes avec les accents - ça peut être une application, ça peut être Windows qui n'a pas écrit de l'UTF-8 dans la partition, mais ça peut aussi être PEBKAC de ma part, par exemple ne pas avoir monté la partition avec le bon charset)
les fichiers avec accents se transfèrent mal d'un ordinateur à un autre.