En effet, Apple se tire une balle dans le pied en faisant payer un certificat pour tester ses appli sur iPhone, mais faut mettre les choses en perspectives:

Pour dev légallement sur DS, c'est genre 5KEuros.
Alors oui, on peut dev pour NDS en achetant un linker, mais on peut aussi dev gratuitement sur iPhone en le jailbreakant (et là pour le coup c'est gratuit (pas besoin d'acheter un linker) et on utilise les outils officiels).