Ça se discute. Je comprends ton point de vue, mais certains programmes mal codés utilisent quand même les chemins en dur, notamment je me suis déjà retrouvé avec un dossier "desktop" parallèle à celui que j'avais déplacé...
Avec un lien symbolique, au moins on est sûr de pas être emmerdé.
Bon, du coup, on peut utiliser les liens symboliques uniquement pour les quelques dossiers spécifiques que tu cites plutôt que l'ensemble, c'est sûr.