Euh, si même les menus ne marchent pas, à mon avis, ce n'est pas du tout un problème de transparence, mais un bogue du pilote graphique utilisé. Essaie peut-être:
QT_GRAPHICSSYSTEM=native systemsettings
pour voir si les menus apparaissent maintenant. Si oui, c'est peut-être que ton pilote X11 utilise un niveau de couleurs par défaut que le graphics system "raster" ne veut pas, essaie de le passer en 32 bpp ou 24 bpp. (Ou définis QT_GRAPHICSSYSTEM=native à portée de système si tu préfères.) Si ça ne change rien, c'est un problème directement dans le pilote.