Pour moi, de base, je préfère Netbeans qui me semble bien plus cohérent. On sens que clairement netbeans, même s'il est lui aussi modulaire, a été pensé comme un tout. Eclipse c'est toujours vu avant tout comme une plateforme sur laquelle on enchevètre des plugins, ce qui aboutit malheureusement souvent à une stabilité aproximative.

Toutes les fonctionnalités que tu cites dans ton lien existent dans Netbeans, certaines depuis même bien plus longtemps qu'Eclipse. Pour le deseigner, bien que celui qu'a racheté puis offert Google soit clairement plus avancé techniquement, je préfère celui de Netbeans. Le fait qu'il soit plus rigide, le rend justement bien plus prévisible.

Par contre le gros avantage d'Eclipse, qui fait qu'il est difficile de s'en passer, c'est qu'il est extrèmement bien fourni pour tous les plugins en tout genre.

Pour finir, il est certes marrant de toujours troller sur java, mais quand je compare Eclipse ou Netbeans a un IDE C++ comparable niveau fonctinalités comme Visual Studio, je ne vois aucune différence que ce soit au niveau de la réactivité, de la consomation mémoire ou de la stabilité.
Après c'est sur que si on compare des IDE a des Editeur de texte avancés, les derniers gagnent. Mais dans ce cas la comparez à JEdit, qui est un modèle de légèreté.