Le markdown permet de faire un fichier texte LISIBLE qui peux etre convertit en n'importe quel autre format.

Hello
===

est plus lisible que

<h1>Hello</h1>

Bonjour *le* monde

et plus lisible que

Bonjour <b>le</b> monde

Le markdown utilise une tendance qu'on certains à formater des fichiers textes purs, utiliser = pour souligner un titre, * pour metre l'emphase, etc...
Le HTML est rapidement totalement illisible.