Cf. par exemple Runtime/File2Hex.exe (dans ce cas, la source est dans le dossier File2Hex), Runtime/patch.exe (source? Si c'est GNU patch, ils sont obligés de la proposer! Si c'est un truc BSD, c'est légal, mais reste contraire aux règles de Debian et Fedora), Runtime/rm.exe (source? Même discours que pour patch), Runtime/OpenTerm (binaire pour je ne sais pas quelle plateforme, peut-être non-libre, source introuvable également).
En plus, ils veulent qu'on patche son wxWidgets (cf. le dossier patches).
Bref, c'est un excellent exemple d'un projet totalement bordélique qui est un cauchemar à packager!