Il n'y a aucun risque a les supprimer les fichier du var-link si tu ne veux pas les garder.
Mais la encore je doute que ça ait le moindre effet, les programmes occupent uniquement de la place en mémoire archive, tant que tu ne les exécutes pas, il n'ont pas de raison de ralentir ta calculatrice surtout si tu as déjà fait un "reset" de la RAM.

Il me semble qu'il n'est pas impossible que les appli-flash aient un impact sur les performances. Il n'y a pas de risque a les supprimer, si ce n'est bien sur que tu perdra les fonctionnalités correspondantes.