Bon, comme prévu avec la solution n°4 le problème est réapparu au premier changement que j'ai fait sur la table "section". MySQL recommence à vouloir scanner cette table en premier, et le problème disparaît si je supprime l'index de "topic" sur les colonnes "section" et "last_time" mais j'en ai besoin donc pas possible.

Je ne sais pas trop comment creuser sur les raisons qui lui font choisir ce plan d'exécution, il est tellement mauvais par rapport à l'optimal que je dois forcément m'être planté quelque part :/