Bon, l'appli Java ne fait pas ce que je veux (et ne détecte même pas mon lecteur). Je suis tombé sur InfoNotary Smart Card Manager, mais pas mieux :/

-> La détection du lecteur fonctionne pour les deux, mais InfoNotary ne détecte pas de présence de carte ; l'appli Java détecte aussi, du coup (ça va mieux en lançant le démon qui va bien ), par contre je ne peux pas avoir simplement de dump de la structure, il faut faire des requêtes bas niveau :/

Edit : J'ai trouvé Cardpeek qui fait presque ce que je veux (mais uniquement presque :/). Il faudrait que je me mette au LUA et que je sache un peu mieux comment lire une carte Mifare/Desfire pour que ce soit bon