Je ne pense pas, mais il y a encore pas mal de projets OSS qui sont basés dessus et qui n'ont pas vraiment d'alternative viable non-java (voire même commerciale). Je pense à yEd, FreeMind (ou des outils plus spécifiques comme LDAP Browser/Editor ou SQuirelL).
Mais je suis d'accord aussi que c'est moins le fait qu'il y ait une vérification des mises à jour qui pose problème que la façon dont c'est géré (chacun dans son coin, de façon non centralisée...).
En fait, on pourrait très bien avoir une alternative au système de paquets avec repo centralisé comme sous Linux, et qui serait un gestionnaire centralisé (sous forme de service+appli), proposé par Microsoft dans Windows, où chaque application pourrait s'enregistrer au moment de l'installation, avec un serveur sécurisé (pas de Microsoft, mais géré par les développeurs de l'application installée) à l'autre bout et une API d'échanges d'informations.