Elle est differente en effet, mais il ya plusieurs choses a prendre en compte la dessus.

Les piles rechargeable on une tension de fonctionnement plus basse que les alcalines (1.2V vs 1.4V) donc la tension minimum qu'un appareil va jouer la dessus (mais seul des appareils mal conçu on de gros soucis avec ça)
L'autre est la capacité de la dite batterie.

Un autre point (mais qui n'a pas, ou plutot ne devrait pas, avoir d'influence dans le cas des consoles est la resistance interne des alcalines vs rechargeable.

En gros les rechargeable sont capable de délivrer plus de courant instantanément sans avoir une chute trop importante de tension contrairement aux alcalines. Et une partie de cette resistance interne change avec la capacité restante de la pile, et les alcalines augmentent nettement plus que les rechargeable.

C'est pour ça que pour certains appareils (genre APN) il est recommandé d'utiliser des rechargeable plutôt que des piles classiques.

Dans le cadre de la WonderSwan, je pense que les rechargeable ne devrais pas poser trop de soucis question durée de vie, surtout avec des piles de hautes capacité, on devrait pouvoir attendre meme une meilleur autonomie.

Pour la NGPC je n'ai aucune idée, sachant qu'ils utilisent 2 piles c'est probablement pour avoir du 3V convertit vers du 3.3 (voir du 5V) c'est que leur convertisseur DCDC est probablement moins efficace que celui utilisé sur la wonder swan (rappel la WS fonctionne en 3.3V en interne, et elle mange du ~0.8-1.5V en entrée)

(Je n'ai pas la tension minimum exacte pour la Swan il faudrait que je refasse des mesures sur ce point, le 0.8V est une tension classique de cut-off pour ce genre de produit.)