Qt et KDE sont strictement compatibles dans le sens "ancienne application - nouvelle lib" (tout comme GTK+ d'ailleurs), donc la seule chose à respecter est d'avoir toujours la version la plus récente* dans le répertoire partagé. Justement, la méthode des DLLs dans les répertoires de chaque programme n'est pas du tout la bonne méthode d'éviter un conflit, il est beaucoup plus efficace d'avoir une et une seule version de la librarie sur le système et de faire en sorte que ce soit la plus récente.

* plus précisément: une version comprise entre la version la plus récente parmi les versions minimales demandées par toutes les applications installées et la version la plus récente disponible