J'ai regardé _rapidement_ l'API GTK+ dans la référence, et je n'ai pas vu de truc permettant de grouper plusieurs fenêtres séparées...
Mais ça fait longtemps qu'il y en a qui pensent que ça pourrait être utile, en particulier sous Windows: http://advogato.org/article/287.html date de 2001, quand même...
[EDIT: le lien que j'ai posté traite aussi de ./56]