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je veux comprendre si ils vous plait quand on dit que le passage de l'etat i à j est certain et calculer ainsi le pasage moyen de l'etat i à j aprés n etape

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Normalement, si on dit que quelque chose "est certain", c'est que la probabilité vaut 1. Donc ça voudrait dire que P(xk=j | xk-1=i)=1.

En revanche, pour ta deuxième question, je ne comprends pas trop ce que tu veux calculer et à partir de quoi. Est-ce que tu veux, à partir de n mesures, calculer la probabilité P(xk=j | xk-1=i)=1 empirique (c'est-à-dire la moyenne sur tes mesures)? Si c'est ça, ben il suffit de compter les occurrences de i (ça te donne un nombre n), puis compter le nombre de fois que c'est suivi par j (ça te donne un autre nombre m), et la probabilité mesurée, c'est P(xk=j | xk-1=i)=m/n.
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