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Quelqu'un pourrait-il m'expliquer ce que fait ION (ou un autre shell) au lancement d'un programme ? Touche-t-il aux system flags, aux interruptions... ?

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Ion se contente de lancer le programme, ce qui est déjà pas mal. Il existe d'autre shell comme MirageOs qui effectivement modifie les interruptions avant de lancer le programme, pour notamment pouvoir le quitter n'importe quand en appuyant sur une touche

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Donc, on ne peut pas être certain de l'état des system flags ?