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Les mises à jour avec Anaconda sont officiellement "supportées" (au même titre que Fedora lui-même évidemment, pas de support au sens commercial), les mises à jour avec apt-rpm ont toujours marché chez moi aussi.

J'ai fait:
RHL 7.3 -> FC1 -> FC2 -> FC3 -> FC4 -> FC5 (FC1->FC2 avec apt-rpm parce que Anaconda boguait, avec Anaconda sinon)
après réinstallation sur un nouveau PC (j'aurais pu migrer et mettre à jour aussi, mais bon...):
FC6 -> F7

Et sur mon PC portable (PII 266 MHz):
FC2 -> FC5 (Anaconda) -> FC6 (apt-rpm) -> F7 (apt-rpm)
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Et t'as pas trop de résidus ou de problèmes avec tes fichiers de configs quand l'architecture des fichiers de conf (en particulier des includes) change ?
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Pas vraiment. Quand il y a un fichier de config que j'ai édité et qui a changé, le mainteneur choisit s'il faut remplacer le fichier et sauvegarder l'ancien (%config -> .rpmsave) ou créer le nouveau avec un nouveau nom (%config(noreplace) -> .rpmnew). Après, je fais en général le nettoyage des *.rpm*, mais ce n'est pas strictement nécessaire.
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